SHIROKANE, the supercomputer at Human Genome Center
Shirokane4 増設に関する変更点 当センターでは、平成 29 年 4 月から、Shirokane3 に Shirokane4 を増設したスーパーコンピュータシステム SHIROKANE の運用を開始いたしました。既にご利用いただいているコース料金に変更はありません。 Shirokane4 の増設による追加部分は、以下の通りです。Shirokane4 は、Shirokane3 と一体として運用いたします。 ホーム Disk を 18 P バイト (3 ファイルシステム) 追加 計算ノードを 140 ノード (145 TFLOPS) 追加 アーカイブディスクのキャッシュエリアを 3 P...
Oasis PUE 東アジアで初めて導入した、Munters 社の間接蒸発式冷却器 Oasis の冷却効率を示します。 PUE による冷却効率の評価 冷却効率は、PUE という指標で評価します。PUE は、以下の計算式で算出します。 W1 = サーバ・ディスク・ネットワーク機器の消費電力W2 = Oasis、直接外気冷却装置、除加湿器の消費電力PUE = ( W1 + W2 ) / W1 仮に冷却に関わる消費電力 (上述 W2 ) が 0 になれば、 PUE は 1 となることからわかるように、PUE...
運用期間: 2015 年 4 月 ～ (現役) Shirokane3 の主要な冷却機器は、間接蒸発式冷却を行う Munters 社の Oasis です。 Oasis は屋外にあり、これに室内で温まった空気を送り込みます。 Oasis 内部には、ポリマー製のパイプ状の熱交換器があります。これに散布される水の気化熱がパイプ内を通過する空気を冷却します。冷やされた空気が室内に戻されます。 Oasis は補器として強制冷却を行うコンプレッサーを備えますが、想定した東京の気象環境下ではこれを使用することはほぼないことを見込んでいます。年間を通じて空気を循環させるファンのみによる冷却が行えるでしょう。 PUE は 1.06 を試算しています。現在のPUE、消費電力データは、冷却性能をご覧ください。 機種の構成: Munters Oasis × 2、直接外気冷却設備 × 2 Operational Status
運用期間: 2015 年 4 月 ～ (現役)2017 年 4 月: キャッシュエリアの増強 ホームディスクと比較して安価で大容量なディスク領域です。高速なストレージ領域 4 PB と、低速・大容量なテープ領域 21 PB からなります。 階層化ストレージ機能により、アクセス日時やファイルサイズ等の条件に従って、自動で 2 つの領域をデータが移動します。 利用者向けの情報 Operational Status
運用期間: 2015 年 4 月 (一部は 2015 年 1 月) ～ 2019 年 3 月 (?) Shirokane2 の 5 倍にあたるディスク容量 12 PiB を有する高速・大容量なディスク領域です。1 ファイルシステムあたり、130,000 回/秒以上のファイル作成処理能力、150,000 回/秒以上のディレクトリ作成処理能力を有します。 構成名 ホームディスク 機種名 MDS/MDT, DDN SFA7700 × 8;...
運用期間: 2015 年 1 月 ～ 2019 年 3 月 (?) 1 ノードあたり 2 TB のメモリ、 48 個の CPU コア、1.6 TB の内蔵フラッシュメモリディスクを搭載した計算ノード群です。ホームディスクなどの共有ディスクの他に 600 TiB の外部ディスク装置に接続します。 構成名 計算ノード Fat ノード数 6 機種名 Dell PowerEdge R920...
運用期間: 2015 年 4 月 ～ 2019 年 3 月 (?) 24 CPU コアの Intel Xeon E5-2670 v3 に 128 GB のメモリを搭載した Shirokane3 で最大の計算ノード群です。計 469 ノードで構成され、うち 24 ノードは演算性能を向上させるためのアクセラレータとして、 Xeon Phi 7120P を搭載します。 構成名 計算ノード...
平成 27 年度からの Shirokane3 の利用料金をご案内いたします。学術利用の場合の Shirokane2 の利用コースとの対応は、次のとおりです。 Shirokane2コース名 Shirokane2料金 (12 か月分) Shirokane3コース名 Shirokane3料金 (12 か月分) 無料 0 円 無料 0 円 BP1 54,000 円 C1 54,000 円 BP2 108,000 円 C2 108,000 円 BP3BG1...
PDF 版 Shirokane3 民間課金表 利用可能な Univa Grid Engine のキューとスロット数 （民間） 無料のコースから大規模専有のコースまで用意しています。 細やかなリソース追加が可能です。 申請内容は月ごとに変更できます。 企業もご利用いただけます。 大学等の学術研究機関に所属の方の利用料金は、科研費などでお支払いも可能です。また、年度末等にまとめてお支払いいただくこともできます。 月々での支払方法の他に、使用開始時の一括払いもできます。 審査には、土・日・祝日と 12 月 29 日から 1 月 3 日までを除いた 5 日間が必要です。 利用規程や課金表は毎年度見直しを行います。
運用期間: 2015 年 1 月 ～ 2019 年 3 月 2015 年 4 月から、次期スーパーコンピュータシステム Shirokane3 の運用を開始しました。Shirkoane3 は高速な処理性能、ファイル I/O 性能を備えるだけでなく、運用中の拡張性、省電力性を兼ね備えたシステムです。 なお、一部を 2015 年 1 月から先行して運用開始しました。 システム構成 計算ノード Fat: 1 ノードあたり 2 TB のメモリに 1.6 TB...
PDF 版 Shirokane2 学術課金表 利用可能な Univa Grid Engine のキューとスロット数 （学術） 無料のコースから大規模専有のコースまで用意しています。 細やかなリソース追加が可能です。 申請内容は月ごとに変更できます。 企業もご利用いただけます。 大学等の学術研究機関に所属の方の利用料金は、科研費などでお支払いも可能です。また、年度末等にまとめてお支払いいただくこともできます。 月々での支払方法の他に、使用開始時の一括払いもできます。 審査には、土・日・祝日と 12 月 29 日から 1 月 3 日までを除いた 5 日間が必要です。 利用規程や課金表は毎年度見直しを行います。
PDF 版 Shirokane2 民間課金表 利用可能な Univa Grid Engine のキューとスロット数 （民間） 無料のコースから大規模専有のコースまで用意しています。 細やかなリソース追加が可能です。 申請内容は月ごとに変更できます。 企業もご利用いただけます。 大学等の学術研究機関に所属の方の利用料金は、科研費などでお支払いも可能です。また、年度末等にまとめてお支払いいただくこともできます。 月々での支払方法の他に、使用開始時の一括払いもできます。 審査には、土・日・祝日と 12 月 29 日から 1 月 3 日までを除いた 5 日間が必要です。 利用規程や課金表は毎年度見直しを行います。
