SHIROKANE, the supercomputer at Human Genome Center
ヒトゲノム解析センターでは、Shirokane6 から部分的に Arm アーキテクチャ CPU の計算ノードを導入しています。 Arm アーキテクチャ CPU は、AMD や Intel が作るメジャーな CPU よりも比較的コア数が多く、電力効率が良い (省電力) ことが特徴の CPU で、富岳スパコンが Arm アーキテクチャ CPU を採用したことでも注目を浴びました。 近年、ユーザ数が急激に増加している SHIROKANE では全体の CPU コア数の確保が課題になっており、多くのコアを省電力で稼働できる Arm アーキテクチャ CPU を搭載したサーバを Shirokane6 で導入していました。...
2 月 16 日 9 時 00 分 から実施しておりました定期点検作業が、2 月 21 日 17 時 30 分 に終了いたしましたことをご連絡いたします。ご協力ありがとうございました。 アーカイブディスクのメンテナンスが 2 月 27 日 18 時 45 分に終了いたしましたことをご連絡いたします。ご協力ありがとうございました。 当センターのサービスを日頃ご利用くださり、ありがとうございます。 下記の日程にて、HGC の計算機システム SHIROKANE の定期点検を行います。定期点検の期間は、すべてのサービスを停止します。 定期点検の日程: 2 月...
1 月 16 日 10 時 00 分 から実施しておりましたアーカイブディスクのメンテナンスが、1 月 19 日 19 時 50 分 にすべて終了致しましたことをご連絡致します。 2023 年 1 月 16 日 (月) 10:00 ～ 20 日 (金) 18:00 ご迷惑をお掛けしますが、ご理解、ご協力の程よろしくお願いいたします。
12 月 29 日 木曜日から 1 月 3 日 火曜日まで SHIROKANE サポート係はお休みをいただきます。 また、本日以降の申請・お問い合わせ等は、年明けの対応になりますことをご了承ください。
HGC スパコン SHIROKANE を使用するための基礎的知識の学習に 最適な SHIROKANE Tutorial 資料と動画を公開いたしました。 Linux の基本操作 資料/動画 ls や cd など Linux を使用するうえで基礎となるコマンドを知ることを目的としています。はじめて Linux に触れる方向けです 利用者入門講習会 資料/動画 AGE をつかい、スパコンならではの Linux の使い方を知ることを目的としています。はじめて SHIROKANE に触れる方向けです 大規模にジョブを実行する際の心得 資料/動画 SHIROKANE の特性を理解し、多量のジョブを効率よく実行できるようになることを目的にしています。数百、数千のジョブを実行する必要のあるユーザ向けです SHIROKANE の利用にあたって知っておくべき内容となっていますので、ぜひご参考としてください。 講習会資料
10 月 26 日 9 時 00 分 から実施しておりました定期点検作業が、10 月 27 日 18 時 15 分 にすべて終了致しましたことをご連絡致します。 ご協力ありがとうございました。 当センターのサービスを日頃ご利用くださり、ありがとうございます。 下記の日程にて、HGC の計算機システム SHIROKANE の定期点検を行います。定期点検の期間は、すべてのサービスを停止します。 定期点検の日程: 10 月 26 日 (水) 9:00 ～ 28 日 (金)...
このメンテナンスは終了しました。 日頃から SHIROKANE をご利用いただき、ありがとうございます。SHIROKANE が接続している SINET6 のメンテナンスのため、 SHIROKANE とインターネット間の通信が停止します。以下の時間帯で 15 分程度の通信断が 1～3 回発生します。 日程: 2022 年 9 月 12 日 (月) 午前 0:00 ～ 1:30 通信停止中は、インターネットから SHIROKANE にログインできません。インターネットと通信しない AGE ジョブへの影響はありません。 以上、ご迷惑をお掛けしますが、ログイン時刻の調整をお願いいたします。
2022 年 7 月 13 日 (水) から、ホームディレクトリが存在する rshare1 の障害が多発しておりました。 障害発生状況 2022 年 7 月 13 日 10 時 38 分から 20 時 10 分 16 日 8 時 42 分 から 9 時...
2022 年 6 月 30 日に Parabricks パイプラインのライセンスを更新いたします。更新の影響については、スパコン Wiki をご覧ください。 スパコン Wiki Parabricks パイプラインのライセンス更新
6 月 16 日 18 時 15 分 から実施しておりましたメンテナンスが、6 月 24 日 16 時 00 分 に終了しました。 ご協力ありがとうございました。 当センターのサービスを日頃ご利用くださり、ありがとうございます。 アーカイブディスクのキャッシュエリアの容量が枯渇した状況が続き、ご不便をおかけしております。この枯渇を解消するため、アーカイブディスクのサービスを停止し、キャッシュエリアのデータをテープエリアへ移します。 サービスの停止は以下の日程で行います。 2022 年 6 月 16 日 18:15 ～ 24 日 18:00 (予定) リコールを実施しているジョブを削除します...
運用期間: 2022 年 4 月 ～ (現役) ホームディスクと比較して安価で大容量なディスク領域です。高速なストレージ領域 2.0 PB と、低速・大容量なテープ領域 54 PB からなります。 階層化ストレージ機能により、アクセス日時やファイルサイズ等の条件に従って、自動で 2 つの領域をデータが移動します。 利用者向けの情報 Operational Status
