SHIROKANE, the supercomputer at Human Genome Center
2 月 12 日 9 時 00 分 から実施しておりました定期点検作業が、2 月 17 日 17 時 20 分 にすべて終了しましたことをご連絡いたします。 点検時間が延長となり、ご不便をおかけしました。ご協力ありがとうございました。 当センターのサービスを日頃ご利用くださり、ありがとうございます。 下記の日程にて、HGC の計算機システム SHIROKANE を停止しての作業を 2 月と 3 月に 2 回行います。この期間は、すべてのサービスを停止します。 1 回目: 2 月 12 日...
2 月 12 日 9 時 00 分 から実施しておりました定期点検作業が、2 月 17 日 17 時 20 分 にすべて終了しましたことをご連絡いたします。 点検時間が延長となり、ご不便をおかけしました。ご協力ありがとうございました。 当センターのサービスを日頃ご利用くださり、ありがとうございます。 下記の日程にて、HGC の計算機システム SHIROKANE を停止しての作業を 2 月と 3 月に 2 回行います。この期間は、すべてのサービスを停止します。 1 回目: 2 月 12 日...
12 月 27 日 土曜日から 1 月 4 日 日曜日まで SHIROKANE サポート係はお休みをいただきます。 また、本日以降の申請・お問い合わせ等は、年明けの対応になりますことをご了承ください。
運用期間: 2026 年 4 月 ～ 2030 年 3 月 2026 年 4 月から、データサイエンスコンピューティングシステム Shirokane8 の運用を開始します。 Shirokane8 は、最新の Intel CPU を搭載した高速な処理性能を備えているほか、 GPGPU に NVIDIA L4 を採用します。また、41.0 PB の大容量ホームディスクを備えています。 システム構成 計算ノード Thin: 96 CPU コアの...
10 月 21 日 9 時 00 分 から実施しておりました定期点検作業が、10 月 23 日 18 時 20 分 にすべて終了しましたことをご連絡いたします。 ご協力ありがとうございました。 当センターのサービスを日頃ご利用くださり、ありがとうございます。 下記の日程にて、HGC の計算機システム SHIROKANE の定期点検を行います。定期点検の期間は、すべてのサービスを停止します。 定期点検の日程: 10 月 21 日 (火) 9:00 ～ 24 日 (金)...
2 月 13 日 9 時 00 分 から実施しておりました定期点検作業が、2 月 18 日 14 時 30 分 にすべて終了しましたことをご連絡いたします。 ご協力ありがとうございました。 当センターのサービスを日頃ご利用くださり、ありがとうございます。 下記の日程にて、HGC の計算機システム SHIROKANE の定期点検を行います。定期点検の期間は、すべてのサービスを停止します。 定期点検の日程: 2 月 13 日 (木) 9:00 ～ 18 日 (火)...
12 月 28 日 土曜日から 1 月 5 日 日曜日まで SHIROKANE サポート係はお休みをいただきます。 また、本日以降の申請・お問い合わせ等は、年明けの対応になりますことをご了承ください。
ログインノード (slogin、snx) は SHIROKANE の入口であり、常に安定して稼働していることが求められます。 低負荷を保てるよう、ログインノードでのプログラムの実行などの作業を禁止し、利用者にはご協力をいただいているところです。参考: ログインノードでできること 2024 年 11 月に発生した SHIROKANE のログインノードの過負荷とその原因 2024 年 11 月頃、ログインノードへの SCP によるデータ転送が遅くなるまたは失敗する状態となりました。 この原因は、複数の利用者が Visual Studio Code (VSCode) の Remote SSH による接続をログインノードに対して行っていたことでした。 ログインノード slogin.hgc.jp が過負荷になり、機能を果たせなくなりました。 VSCode の Remote SSH...
ユーザが qlogin し、コマンドラインにジョブを入力するインタラクティブジョブを実行するために、SHIROKANE では計算ノード Thin (以下、intr.q ノードとする) があります。今回は、intr.q ノードで発生する “過負荷” による影響と対策についてご紹介します。 2024 年 8 ～ 9 月に発生した qlogin できなくなった事象 intr.q ノードは 2024/8/11 15:00 頃 ～ 8/13 9:50 頃、8/14 14:30 ～ 15:30 頃、9/23 2:45 ～...
